菏泽市博物馆是一座地志性博物馆，为隶属于山东省菏泽市文化局的副县级公益性事业单位，位于菏泽市华英路537号，占地面积13000平方米，北部为建筑面积3000多平方米的展厅楼，西部为办公区。主体楼为钢混中空顶结构，外观雄浑庄重。1996年4月正式开馆。
1967年，原菏泽地区革命委员会决定在菏泽城东关外路北城墙以东、1.76复古传奇原地区印刷厂路南建设“菏泽地区毛泽东思想胜利万岁展览馆”，三层，建筑面积1800平方米。1969年竣工，1971年原菏泽地区革命委员会决定将大楼改为菏泽宾馆，1972年更名为菏泽地区展览馆。1980年6月，菏泽地区展览馆与菏泽地区文物管理站合并成立菏泽地区文展馆，1985年1月，菏泽地区文展馆更名为菏泽地区博物馆。1991年12月菏泽地区博物馆选址建设新馆，1996年4月正式开馆。2000年菏泽地区撤地改市，菏泽地区博物馆遂更名为菏泽市博物馆。
菏泽市博物馆的基本陈列为《菏泽市馆藏文物精品展》，陈列面积296平方米，共分为陶器、瓷器、青铜器、玉器、杂项等五部分，共展出藏品近百件。其中较为重要的展品有宰甫卣（晚商）、鎏金佛像（北齐）等。晚商青铜酒器宰甫卣，蘑菇形钮盖，盖顶、器腹饰兽面纹，盖沿、圈足饰夔纹、兽面纹，提梁饰勾连纹，两端饰牛首。器盖和器底内壁对铭三行23字 ，大意是，殷王自豆麓狩猎归来宴飨时，赏给宰甫五串贝，宰甫因作此器以志其事。其他长期专题陈列主要有《菏泽市木版年画展》，陈列面积296平方米、《菏泽市博物馆馆藏书画展》，陈列面积296平方米。
菏泽市博物馆现有藏品总数为8763件，其来源有征集、收购、考古发掘品移交、社会捐赠等渠道，分为陶器、瓷器、金属器、书画、玉器、古籍善本、杂项等七大类。
1999年9月29日至10月20日举办的《辉煌的历程——菏泽地区50年建设成就回顾展》1.76复古传奇获山东省文化厅颁发的庆祝建国50周年“一馆一展”评比活动优秀奖和菏泽地委、行署颁发的“庆祝建国50周年活动组织奖”。2002年8月，来自德国、意大利、罗马尼亚、奥地利、土耳其等国家的画家、雕塑家及来自北京、济南等地国内部分知名画家，在菏泽市博物馆举办了《中外艺术家迎奥运绿色行动菏泽行画展》。自2003年举办首届起，至2008年菏泽市博物馆已成功承办了6届“牡丹杯”全国书画名家作品展。
根据中宣部、财政部、文化部和国家文物局联合印发的《全国博物馆、纪念馆向社会免费开放工作通知》要求，积极响应开始对外免费开放。菏泽市博物馆馆长高国庆同志携全体工作人员，热忱欢迎中外来宾莅临参观指导！
