远古时期的菏泽，不仅是一片水乡泽国，而且濒临黄河，先民们为避水患和野兽的袭扰，便在高地上筑室而居，且不断地将住地加高。随着河水泛滥横溢，这些聚落也渐次增高，形成了高出周围地面的“堌堆”。其时间，大致相当于大汶口文化晚期到春秋战国，后来则成为公共墓地或庙宇。目前境内尚有这种“堌堆遗址”156处，其中有1处为国家重点文物保护单位，9处为省级重点文物保护单位。依据考古调查和发掘可知，这些“堌堆遗址”的文化序列是大汶口文化、龙山文化、商文化等。
安邱堌堆遗址
位于菏泽城东南12公里佃户屯办事处曹楼村东，因其上建有安邱寺而得名。现存堌堆高3米，长、宽各50米，四壁较直，断面暴露有文化层。经钻探，遗址堆积甚厚，可达4米以上，总面积5000多平方米。1969年和1976年春，山东省博物馆和菏泽地区文物站曾先后两次在此进行试掘。1984年，北京大学考古系教授邹衡又带领数名研究生和本科生，对此进行正式发掘，找到了商代、岳石、龙山的文化堆积层；发现了灰坑、灰沟、陶窑、墓葬和长方形、圆形、长方形圆角的房子等文化遗迹；出土了打制粗糙的石器，磨制精美的石斧，有明显使用痕迹的蚌镰、蚌刀、骨针、骨锥、骨镞，造型规范的盆、碗、罐、鬲、瓮、器盖等大批文化遗物。岳石文化层的发现，在横向方面填补了该文化在鲁西南地区的空白，在纵向方面也基本填补了鲁西南地区龙山文化与商文化之间的空白。这无论对考古学，还是对历史学都有重要的意义。2001年6月25日，该堌堆被中华人民中和国国务院公布为全国重点文物保护单位。
莘冢堌堆遗址
位于曹县城西北约5公里的莘冢集村，东西长192米，南北宽168米，总面积为32256平方米。一条东西走向的道路把遗址分为南北两个土丘。南丘稍高于四周地面，北丘高出地表约2米，保存较好。1976年和1979年春，文物工作者在此进行了两次发掘，所得遗物十分丰富，既有大量的陶器残片、骨器和少量的石器，又有大量的鱼刺、螺壳和少量的兽骨等。通过发掘整理分析，考古专家认定，莘冢集遗址为大汶口、龙山、商、周四个时期的文化堆积，其中以龙山文化层为最厚，出土文物也最丰富。从横向上看，莘冢集遗址既包含典型龙山文化的因素，又具有河南龙山文化的某些特征，因而是介于二者之间的另一种类型的龙山文化遗存。从纵向上看，大汶口文化是其源头，但到了龙山时期，由于受河南龙山文化的冲击较重，方才出现了如此复杂的文化面貌。
窦堌堆遗址
位于东明县胡庄乡杨楼村东北约800米处，南距七里河1500米，北距贾河2000米。该堌堆呈覆锅状，南北长76米，东西宽52米，高约2．5米，占地约3952平方米。1976年，菏泽地区文物工作队在此进行了调查性试掘，在其东北部开了一条南北长10米、东西宽2米的探沟。探沟东剖面共分五层：第一层是耕土层，厚10至35厘米；第二层为灰褐土，土质松软、纯净，厚30至192厘米，内有一座东汉砖室墓，随葬品除一枚铜质印章外，其他均为陶器；第三层仍为灰褐土，但稍硬，并含有少量陶片，厚10至100厘米；第四层为黄褐土，土质较硬，厚20至90厘米；第五层又为灰褐土，土质较硬，藏有大量灰陶、黑陶片和部分骨、蚌器、石刀、石斧等，但因地下水位较高而停止发掘，未到生土。整个遗址从其剖面分析，可分为三个时代，第二、三层为战国、秦、汉文化层，第四层为商、周文化层，第五层为龙山文化层。该遗址文化层堆积较厚，文化内涵十分丰富，延续时间长，保存状况基本完好。
安陵堌堆遗址
位于曹县韩集镇孙庄村北，东南距县城约29公里。该遗址南北长225米，东西宽150米，总面积33750平方米，呈南北长于东西的椭圆形。由于被革命烈士陵园建筑物所占压，故该遗址保护比较完好。从遗址的西侧剖面考察，上部为汉代文化层，中部为战国时期文化层，下部为新石器时期文化层。该遗址文化层堆积较厚，内涵比较丰富。遗址上散布着大量陶片，从采集的标本观察，可以看出器形的有夹细砂红陶鬲、夹砂灰陶罐、泥质灰陶绳纹罐、泥质灰陶素面豆等，还有箭、簇等遗物。
官堌堆遗址
位于定陶县邓集乡姜楼村南400米处，南北长82米，东西宽80米，总面积6560平方米。20世纪60年代，该遗址受到严重破坏。现存堌堆四壁陡峭，顶部南北15米，东西仅8米，底部南北30米，东西15米，高8米。文化层暴露十分明显，有灰层、烧土面、蚌壳坑和灰坑等，文化内涵十分丰富。建国后，考古工作者在此发现并采集了新石器时代和商、周时期的大量遗物，计有鹿角化石、野生动物骨骼、牙齿、石刀、石斧、石镰、骨针、贝壳、陶片等。据传，堌堆之南曾立有清代石碑一通，镌文曰：“汉高祖受命坛。”现已无存。《定陶县志》载：“受命坛在城西北十里许，汉高祖即位于氾水之阳，即此。高阜犹存，今名官堌堆。”
梁堌堆遗址
位于曹县侯集镇梁堌堆村北，东西长200米，南北宽150米，面积30000平方米。现存台地东西长40米，南北宽35米，高达5米。自1963年发现该遗址以来，考古工作者进行过多次实地调查，证实它是一处龙山、岳石、商、周、汉等不同时期的古代文化遗址。至今从陡直的断面上还可以看到龙山、西周、汉等时期的夯筑台面。梁堌堆原称景山。据文献记载，商汤曾在此会盟九夷，消除了后顾之忧，就开始行“景亳之命”，自东向西灭夏。为此，有人把它说成是一处千古不朽的商汤革命纪念地。“景山夕翠”还是曹县八景之一，历代文人墨客常到此凭吊吟咏，抒发情怀。董味清有诗赞曰：“景山松柏赋丸丸，翠点晴峰入夕观。云气远横疑壁障，斜阳返照似春索苔石千重碧，秋老枫林四绕丹。众岭于今骧首望，烟姿柳色锁层峦。”
昌邑故城遗址
《巨野县志》载：“昌邑集，有故城，每当阴雨望之，犹隐隐有城关形。”昌邑集即现在的巨野县昌邑乡，历史上曾是古昌邑国的都城。1992年6月，该城址被山东省人民政府公布为省级重点文物保护单位。
1980和1982年，菏泽地区和巨野县文物工作队对该遗址进行了两次考察，粗略地勾勒了城址的轮廓。古城平面略呈方形，东城墙长1215米，西城墙长1377米，北城墙长1585米，南城墙长1720米。这四面墙有的高出地表1—2米，有的在地表以下30—60厘米，土质粘性黑土，掺有石灰，分段板筑，夯层每层9—11厘米不等，夯窝直径5厘米，古城内有前后昌邑和城角刘、侯花园村。从当地群众提供的情况推测，现在的“西堌堆”远看如一道山岭的城墙遗址，便是古城的西门。现在的城角刘村，便是古城的西北城角。
在城址范围之内，曾采集到大量的汉代遗物和少量的战国遗物。汉代的陶器，多为泥质浅灰色陶，少量泥质红陶器物有瓦、板瓦、浅盘细柄豆、小鼻罐及外印绳纹、内饰五珠的钱纹陶片，另外还有铜弩机和铜镞等。
大量的文化遗存，为研究古昌邑城的历史及发展提供了实物资料。昌邑，春秋战国时期为邑，秦为县，西汉为郡治，东汉兼属兖州刺史部。从战国到秦汉正是昌邑的繁荣昌盛时期，这一带是当时重要的交通要道。到了西汉景帝中元六年（前144），分梁地置山阳国，封梁孝王之子刘定为国王，从此昌邑城就成了王国之都。汉武帝建元五年（前135），改山阳国为山阳郡。天汉四年（前97），改山阳郡为昌邑国，封其子刘髆为昌邑王。
西汉时期，昌邑城内已有了自己的冶铁业和管理冶铁的铁官，是全国49处从事铁器生产的官办工业之一。据《元和郡县志》记载，唐朝此地尚有铁柱出土。自古以来，昌邑便是兵家必争之地，如秦二世二年（前210）的“楚汉之战”，汉景帝三年“七国之乱”时平叛之战，都发生在这里。
昌邑是魏武帝曹操的封地，东汉末曹操任兖州牧，封费亭侯于此。自西汉至魏晋，昌邑城哺育出许多文臣武将，创造了灿烂的文化。兖州剌史杨叔慕碑以其精湛的书法艺术和重要的文物价值被定为国家二级文物藏品，收藏在故宫博物院。
宋朝以后，撤销郡国，昌邑也被降为镇，经济文化渐趋衰落。元末明初，黄河几次大决口，厚厚的泥沙把这座古城湮没在黄土之下。
齐鲁会盟台遗址
齐鲁会盟台位于巨野县城西大李庄村北。据《兖州府志》记载：原台“崇数仞，广可蔽二亩。”元末明初，由于黄河多次决口淤积，再加雨水冲刷，会盟台面积逐渐缩小。现存台高约2.8米，南北长24米，东西宽34米，总面积为816平方米，形似覆斗状。在其东南角的地面上，散存有战国时期至汉代的陶片，如红陶绳纹鬲足、灰陶罐、灰陶豆等。
据《山东通志》载：“会盟台在县西南三里，昔齐鲁会盟处”。周王朝建立后，采用“封建亲戚，以藩屏周”的措施，分封王室贵胄。鲁国是周公长子伯禽的封地，当时虽以头等王国就封，但到了春秋时期，国力渐衰。大野地处鲁之西境，常常受到宋国的侵扰。为了加强防御，鲁国主动与齐国结盟。据《春秋》记载，鲁庄公三十年（前664），在大野泽西济水之南筑台，齐鲁两国会盟于此，从而使鲁国的国势地位大大提高，齐鲁两国关系进一步巩固，军事防御能力得到加强。会盟台是齐鲁友好的象征，也是齐鲁文化交融的标志，对于研究春秋时期齐鲁两国的社会、政治、文化及春秋战国时期邦交史，有着重要的意义。秦汉时期，此处又成为重要祭祀场所。
